Hola, Georges.
En Paratext solo puede tener un interlinear por idioma, pero tantos interlineares como desee, siempre que sean de idiomas diferentes. Por ejemplo, podría tener un interlinear de glosas en francés, una traducción inversa al inglés, etc.
Si entiendo correctamente, el mensaje aparece porque ya ha configurado un interlinear basado en francés. Sería el interlinear de glosas con el texto modelo LSG. Imagino que el mismo mensaje le indica si desea reemplazarlo con su nueva configuración (interlinear NVS) o mantener la configuración francesa anterior (Glosas con LSG).
Saludos,
Pepe.