La configuración del interlineador puede ser confusa; normalmente tengo que mirarla varias veces. Según la captura de pantalla, parece que has elegido la opción de Crear basado en un texto modelo. Cuando eliges esta opción, hay una nota bajo el cuadro de texto de salida que dice "Output glosses to a standard, daughter or auxilary project". Ten en cuenta que las retrotraducciones no aparecerán en esta lista. Si quieres hacer la salida a tu retrotraducción, debes elegir la opción de crear una retrotraducción.