Li sua mensagem e pensei que poderia dar algumas respostas. Então cliquei no link... e percebi que era uma pergunta feita originalmente por mim!
Como Phil disse naquela outra resposta, usar números de capítulos no glossário quebra a ferramenta de vínculo de Termos Bíblicos. Então, se você usa essa ferramenta, definitivamente não pode usar múltiplos capítulos.
Se sua necessidade principal é simplesmente organização, usar marcadores \s1, como você mencionou, pode ser a melhor escolha. Mas, como escrevi naquela outra thread, nosso projeto era basicamente inutilizável porque o glossário tornava o programa muito lento. Se essa é sua experiência, então talvez você precise usar marcadores \c.
Não me lembro se essa é a circunstância, mas lembro de uma ocasião em que tive que desligar o PT, abrir um arquivo em um editor de texto e adicionar capítulos manualmente. Então, quando reabri o PT, funcionou corretamente. Então, talvez essa seja a maneira de fazê-los funcionar sem que o PT os remova. Uma vez que estão no lugar, nunca tive problemas com eles.
Não usei imagens no PTXprint o suficiente para poder comentar sobre isso. Meu palpite é que usar capítulos não corrigirá nem prejudicará seus problemas com o PTXprint.
