Похоже, это ошибка.
Paratext должен записывать в файл user.config раздел ProjectFontOverrides, но, видимо, он записывает переопределение для Joined Named (т.е. HEB/GRK), а не для проектов HEB или GRK.
Это можно исправить, вручную отредактировав user.config (но этот файл немного трудно найти).
Вот шаги, которые должны сработать:
1. Измените шрифт для ресурса (как вы уже сделали).
2. Закройте Paratext.
3. Найдите файл user.config.
В окне проводника перейдите в c:\Users\{YOUUSERNAME}\AppData\Local\United_Bible_Societies\
Там должен быть один или несколько файлов Paratext.exe_Url_??????????.
Откройте тот, у которого самая поздняя дата изменения.
Затем там должен быть один или несколько папок с версиями. Выберите ту, которая соответствует вашей версии Paratext.
Откройте user.config в Блокноте и найдите <string>HEB/GRK</string>
Замените HEB/GRK на GRK (если вы пытаетесь изменить шрифт GRK) и сохраните файл.
4. Снова откройте Paratext, и шрифт GRK должен измениться в проекте HEB/GRK.
И/или используйте опцию «Give Feedback» (Дать обратную связь), чтобы сообщить об ошибке.
Некоторая старая информация об этом здесь:
https://support.bible/1585/hack-to-change-fonts-paratext-8-uses-for-resources