.12 — это исправление, но оно ещё не было распространено среди всех пользователей.
Если вы установите этап выпуска (release stage) в Paratext на «pre-release», вы получите обновление .13 (даже новее, чем .12), которое также должно решить проблему с необходимостью базового проекта.
Этап выпуска можно найти в разделе поддержки и разработки (support and development) в главном меню, который появляется, если удерживать Shift при открытии меню.