Estou fazendo isso. Nosso glossário se parece mais ou menos assim:
\c 1
\cl A
\p
\v 1 O~\k Aron\k*: O phral ....
...
\c 2
\cl B
e assim por diante.
Isso significa que, se você colocar uma nota no glossário, o Paratext não duplica o glossário inteiro na nota. (talvez esse bug tenha sido corrigido, não sei), (opcionalmente) fornece cabeçalhos de glossário, e assim por diante.
(Observe que o O~ é porque os nomes na língua precisam de um artigo antes deles, muito parecido com o grego koiné. O Paratext adiciona desajeitadamente um espaço após o til, mas, se houver um til, ele não o separa como se fizesse parte da definição anterior quando decide ordenar o glossário. Os espaços após os tils são fáceis de corrigir no arquivo de alterações.