He podido realizar una breve investigación de algunos de estos informes. En un caso, el archivo llamado "unique.id" se cambió varias veces en las últimas horas; en otro caso, fue el archivo "license.json". Se ha notificado a los desarrolladores.
Mi evaluación es que estos archivos son secundarios, cosas de las que solo Paratext "se preocupa", por lo que el núcleo de los datos del proyecto sigue estando bien.