Я проверил код Paratext, и похоже, что лемма для \w surface form|lemma\w* должна транслитерироваться, поэтому я не уверен, почему это проблема для вашего проекта.
Пожалуйста, отправьте отчет об ошибке, чтобы мы могли рассмотреть детали вашего проекта.