Дело не в том, что «печатается только номер первой главы». Скорее наоборот: печатаются все номера глав, кроме первого. Но при более тщательном осмотре я вижу, что это была моя ошибка.
Для контекста: я пытаюсь печатать напрямую из проекта Paratext, а не из модуля. Я обнаружил, что если я пытаюсь печатать целые главы, буквицы с номером главы появляются в начале каждой главы, как и ожидалось. Но то, что я пытался напечатать, было: LUK 2:1-40, LUK 3-6, LUK 11.
Естественно, буквицы появляются без проблем в главах 3-6 и 11, но не в главе 2, потому что я пытался напечатать не всю главу. Вот откуда у меня возникло впечатление, о котором я написал в своем вопросе.
В конечном итоге мне помогло включить опцию "Hide Empty Verses" в настройках, а затем просто попытаться напечатать LUK 2-6, LUK 11. И тогда буквицы появляются в каждой главе.