Ce n'est pas « seulement le numéro du 1er chapitre qui est imprimé ». C'est l'inverse : tous les numéros de chapitres sont imprimés, sauf le 1er. Mais après vérification, je vois que c'était une erreur de ma part.
Pour contexte, j'essaie d'imprimer directement depuis un projet Paratext, donc pas un module. J'ai découvert que si j'essaie d'imprimer des chapitres entiers, le numéro de chapitre en lettrine apparaît au début de chaque chapitre comme prévu. Mais ce que j'essayais d'imprimer était : LUK 2:1-40, LUK 3-6, LUK 11.
Naturellement, les lettrines apparaissent parfaitement aux chapitres 3-6 et 11, mais pas au chapitre 2, car ce n'est pas le chapitre entier que j'essayais d'imprimer. C'est là que j'ai eu l'impression décrite dans ma question.
Ce qui a finalement fonctionné pour moi, c'est d'activer l'option « Masquer les versets vides » dans les paramètres, puis d'essayer d'imprimer LUK 2-6, LUK 11. Et alors, les lettrines apparaissent à chaque chapitre.