É difícil saber sem ver o layout da sua tela ou uma captura de tela antes e depois. Você está usando o Paratext 9.3? Os programas do Windows geralmente não gostam de permanecer no lugar, especialmente se forem pequenos e, especialmente, se você estiver alternando entre a tela de um notebook e um monitor.
Se você estiver usando apenas um único painel, pode considerar abri-lo como uma janela flutuante. Essa janela flutuante pode ter mais probabilidade de permanecer onde você deseja.
Como último recurso, você pode usar um programa que permita definir regiões específicas onde você deseja que uma janela fique. Eu usei o Microsoft Power Toys (Fancy Zones) para criar áreas personalizadas que me permitem encaixar rapidamente janelas naquele local. Basta segurar a tecla Shift e as zonas que criei aparecem, e eu posso arrastar minha janela para aquele local.
