Vejo o que está acontecendo. Sua entrada lexical é haruanga babuna, que está mapeada para pasilanga babuna. A capitalização da primeira palavra é mantida, mas a da segunda não. O mecanismo de transferência do FLExTrans não consegue lidar com isso, então você terá que fazer uma alteração pós-síntese.
No caso de Sipsipka virar Sipsip xa, como isso é produzido por uma regra, você pode envolver a string literal que está sendo exibida com o elemento 'get-case-from'. Ficaria assim:

Isso significa que, se a palavra original que entra estiver em maiúsculas, o xa sairá em maiúsculas. Da mesma forma, se estiver em minúsculas, sairá em minúsculas.
Mas, você pode ter outras palavras em um título de seção que estão saindo em minúsculas por vários motivos. Então, você pode querer uma solução geral para colocar todas as palavras em Capitalização de Títulos.
Não existe uma expressão regular de uma linha que faça isso. Então, vejo duas soluções possíveis:
1) Adicionar um módulo personalizado ao seu conjunto de módulos de Drafting que execute algum código Python para capitalizar todas as palavras em um cabeçalho de seção.
2) Adicionar uma expressão regular para cada letra do alfabeto. Não é tão bom ter 26 expressões nas suas regras de Text Out, mas funciona.
A expressão para 'a' seria Search For: (^\\s.*?\b)a(\w*) Replace with: \1A\2
Para facilitar a adição de todas essas, você pode adicionar as seguintes linhas xml abaixo de <SearchReplaceRules> no arquivo Output\fixup_synthesis_rules.xml:
<SearchReplaceRule RegEx="yes" Inactive="no" Comment="">
<SearchString>(^\\s.*?\b)a(\w*)</SearchString>
<ReplaceString>\1A\2</ReplaceString>
</SearchReplaceRule>
<SearchReplaceRule RegEx="yes" Inactive="no" Comment="">
<SearchString>(^\\s.*?\b)b(\w*)</SearchString>
<ReplaceString>\1B\2</ReplaceString>
</SearchReplaceRule>
<SearchReplaceRule RegEx="yes" Inactive="no" Comment="">
<SearchString>(^\\s.*?\b)c(\w*)</SearchString>
<ReplaceString>\1C\2</ReplaceString>
</SearchReplaceRule>
<SearchReplaceRule RegEx="yes" Inactive="no" Comment="">
<SearchString>(^\\s.*?\b)d(\w*)</SearchString>
<ReplaceString>\1D\2</ReplaceString>
</SearchReplaceRule>
<SearchReplaceRule RegEx="yes" Inactive="no" Comment="">
<SearchString>(^\\s.*?\b)e(\w*)</SearchString>
<ReplaceString>\1E\2</ReplaceString>
</SearchReplaceRule>
<SearchReplaceRule RegEx="yes" Inactive="no" Comment="">
<SearchString>(^\\s.*?\b)f(\w*)</SearchString>
<ReplaceString>\1F\2</ReplaceString>
</SearchReplaceRule>
<SearchReplaceRule RegEx="yes" Inactive="no" Comment="">
<SearchString>(^\\s.*?\b)g(\w*)</SearchString>
<ReplaceString>\1G\2</ReplaceString>
</SearchReplaceRule>
etc.