Сложно предложить решение, не видя данных. Судя по сообщению, в файле TDX, вероятно, есть более одного \ie. В файле должен быть только один \ie.
Предупреждения о \ili и \il2 просто означают, что вам нужно будет добавить стили для этих маркеров. Я не вижу этих стилей в шаблонах GPS.
Если в файле TDX все настроено как стили введения, я рекомендую убрать «i» из маркеров и использовать обычные стили \li и \li2. Если вы хотите, чтобы текст был меньше обычного, можно уменьшить размер шрифта для этой книги.