Здравствуйте.
В таком случае то, что вам нужно, — это специальная клавиатура для языка, и это можно сделать с помощью Keyman. Вы можете поискать, есть ли клавиатура для вашего языка на keyman.com, или получить помощь в создании одной с использованием Keyman Developer.
Имея это, вы сможете использовать конфигурацию клавиатуры Paratext и, например, использовать клавиатуру, созданную в Keyman, для текста, а английскую клавиатуру — для заметок.
Если вам нужно изменить лишь несколько символов, я разделяю мнение Фила о том, что файла Autocorrect.txt будет достаточно, если просто лучше настроить комбинации.
В случае с Autocorrect.txt стоит отметить, что это не его функция, поэтому он не удовлетворит этому запросу. Назначение Autocorrect.txt — применяться во всех местах проекта. Это полезно, например, когда команда хочет использовать длинные тире или открывающие кавычки, которые невозможно ввести напрямую с физической клавиатуры.
С наилучшими пожеланиями,
Пеппе.