Я запутался в вашем заявлении о том, что выбранный вами шрифт не используется в Глоссарии. Единственный способ, которым это могло произойти, — если вы используете файл custom.sty или frtbak.sty, который изменяет шрифт. Это произойдет, если в листе стилей есть строка, указывающая другой шрифт, например:
\Fontname Courier New
Однако ваше последнее замечание о заглавной I (i) и строчной l (L) является результатом использования шрифта Arial, поскольку этот шрифт визуально не различает эти два символа. Чтобы лучше различать символы, вам следует использовать шрифт с засечками, например Charis. Когда вы находитесь в настройках языка, есть место, где можно ввести пример текста. Вы можете протестировать разные шрифты, введя эти два символа рядом друг с другом в области примера.
I’m confused by your statement that your selected font is not being use in the Glossary. The only way that this might happen is if you are using either a custom.sty or frtbak.sty flie that changes the font. This would happen if the style sheet contains a line like this to specify a different font:
\Fontname Courier New
However, your last comment about capital I (i) and lowercase l (L) is the result of using the Arial font since that font does not distinguish visually between these two characters. To better distinguish the characters you should use a serif font like Charis. When you are in the language settings there is a place to type an example text. You can test different fonts by typing these two characters side by side in the example area.