Sim, pelo que posso ver, isso parece ser um bug. Mas me pergunto se funcionaria melhor se a diglota (ALEPH) fosse o projeto primário e chamasse o PRK como projeto secundário.
Presumivelmente, você consegue obter a língua original acima ao executar o ALEPH de forma independente, e ele só falha quando se junta a outro texto como uma diglota.
Infelizmente, o Arquivo enviado não conseguiu capturar e empacotar a pasta interlinear para o ALEPH. Você poderia enviar outro arquivo apenas com um interlinear do ALEPH para que possamos replicar o problema e, com sorte, resolver a questão?