Tuve pensamientos similares a los de las otras dos respuestas aquí, pero tengo algunos comentarios adicionales.
1) Si solo planea evitar que se publiquen unas pocas notas al pie o entradas del glosario, entonces eliminarlas semimanualmente en el momento de la publicación es la mejor opción. Como dijo @Phil_Leckrone, muchas herramientas de publicación incluyen alguna forma de crear "Cambios", donde puede darles una regla que aplican. Esto puede incluir reglas como "eliminar una nota al pie que comienza con estas ciertas palabras" o "eliminar la entrada del glosario con este término en particular".
2) Si cree que habrá muchas de estas notas al pie/entradas del glosario, entonces valdrá la pena dedicar tiempo a configurar el uso de diferentes marcadores para diferenciarlas. Pero, a diferencia de lo que dijo @LivingField, no recomendaría usar incorrectamente un marcador existente (como \fe). En cambio, crearía un nuevo marcador en custom.sty que se llame algo como \zfapp o \zfprint o \z-f-app o similar (no recuerdo de inmediato si se permite el - en el nombre de un marcador). Comenzar el nombre con \z es una gran manera de advertir a todos que "este es un marcador que estamos usando de manera no estándar".
Luego, cuando llegue el momento de la impresión, simplemente puede establecer \TextProperties publishable o \TextProperties nonpublishable para obtener los resultados deseados.
I had similar thoughts to the other two answers here, but have a few additional comments.
1) If you only plan on stopping a few footnotes or glossary entries from being published, then semi-manually deleting at the time of publication is the best option. As @Phil_Leckrone said, many publishing tools include some way of creating "Changes", where you can give it a rule which it applies. This can include rules like "delete a footnote that starts with these certain words" or "delete the glossary entry with this particular term in it".
2) If you think there will be a lot of such footnotes/glossary entries, then it will be worth your time to set up using different markers to differentiate. But unlike what @LivingField said, I wouldn't recommend using a pre-existing maker incorrectly (like \fe). Rather I'd create a new marker in custom.sty which is named something like \zfapp or \zfprint or \z-f-app or the like (I can't remember off the top of my head if - is allowed in a marker name). Starting the name with \z is a great way of warning everyone that "this is a marker we're using in a non-standard way".
Then, when it comes time for print, you can simply set \TextProperties publishable or \TextProperties nonpublishable to get your desired results.
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