Извините за столь поздний ответ. Что касается TeX, существует команда, которую можно использовать:
\NumericCallers{f} (или {x}). Однако она, по-видимому, работает только в том случае, если не были определены «списочные» ссылки, и, судя по всему, избежать этого через пользовательский интерфейс невозможно. В одном из проектов я вижу:
\AutoCallers{f}{*,†,‡,¶,§,⁜,⁑,※,⁂}
\AutoCallers{x}{a,b,c,d,e,f,g,h,i,j,k,l,m,n,o,p,q,r,s,t,θ,u,v,w,x,y,z,ʒ}
примерно на строке 170 в файле .tex, что значительно раньше, чем подключается ptxprint-mods.tex (примерно на строке 488).
Поэтому мы можем «сбросить» список автоматических ссылок, и тогда числовые ссылки должны заработать:
\expandafter\let\csname callers-x\endcsname\relax
\NumericCallers{x}
И это работает:

Но (по крайней мере, при неизменном шрифте) ссылки выглядят немного запутанно, если честно:

(замените callers-x и {x} на callers-f и {f}, если вы хотите переопределить сноски.)