Suponho que você esteja perguntando sobre como referenciar parágrafos para usar a notação `\p^95` e a lista de ajustes?
Para a lista de ajustes, em vez de "GEN 11.27 +1", o formato seria algo como: "GLO k.Temple +1" O que significa, no Glossário, adicionar um ao parágrafo em que o termo-chave Temple (\k ... \k*) é definido.
Infelizmente, o arquivo de alterações não entende automaticamente esse formato. (Não se pode dizer "at GLO k.Temple ...." que eu saiba).
As versões mais recentes têm um visualizador de PDF que permite clicar com o botão direito do mouse no parágrafo, o que deve abrir uma caixa de opções com o título contendo a referência. Acabei de verificar e parece (pelo menos com meu USFM) que as alterações da lista de ajustes são processadas corretamente usando essa nova interface.
As modificações de estilo no arquivo de alterações, no entanto, ainda não parecem estar funcionando, então você ainda está na situação de precisar escrever manualmente entradas no arquivo de alterações, algo como:
at GLO "\\p([^\\]*\\k Temple\\k\*)" > "\\p^95 \1"