Se corrigió un error (bug) hace unas semanas en el que los números de versículo chocaban con los números de capítulo. Podría deberse a que la corrección de ese error no funcionó bien, pero no puedo reproducir lo que estás informando en mis casos de prueba.
¿Podrías (a) asegurarte de tener una copia reciente de PTXprint, ya que las actualizaciones se producen aproximadamente cada semana, y (b) publicar una captura de pantalla que, de preferencia, incluya también una sangría de párrafo normal para comparar? (c) también publica la parte relevante del "SFM final" (final SFM), ver la pestaña "Ver" (view) en la vista completa. Es posible que los cambios (ya sean automáticos o manuales) estén convirtiendo tu \m en otra cosa.