O Paratext não manipula diretamente o texto conforme ele é exibido - isso é feito pela combinação do controle HTML baseado no navegador Firefox que usamos e da fonte utilizada para o seu projeto.
Atualizamos o componente HTML entre o Paratext 8 e o Paratext 9.4. O controle no Paratext 8 era baseado no Firefox 45 e o controle no Paratext 9.4 é baseado no Firefox 60.
No menu Avançado (Advanced) do menu Projeto (Project), há uma opção para exportar o texto como HTML. Você pode tentar abrir o arquivo no Firefox para ver como ele é exibido lá - se for exibido corretamente, pode ser uma configuração que estamos usando para o controle e você pode criar um relatório de problema no Paratext com os detalhes e o HTML de exemplo.